然而，德雷克和諾里斯并沒有忠實(shí)地遵從女王的訓(xùn)令，擅自決定進(jìn)攻里斯本，反而消耗了眾多的兵員，又未獲得重大戰(zhàn)果。

因此，她對遠(yuǎn)征回國的將領(lǐng)十分冷淡，甚至傳令德雷克和諾里斯入宮受訊，要求他們解釋不按女王命令行事的原因。被國民譽(yù)為民族英雄，長期深受恩寵的德雷克，以這次失敗為轉(zhuǎn)機(jī)，逐漸失寵和被疏遠(yuǎn)了。

英國在1595年從法國撤出軍隊后的三年里,又發(fā)動了三次與西班牙的大規(guī)模海上戰(zhàn)爭。首先出臺的是德雷克的美洲冒險計劃。他企圖占領(lǐng)巴拿馬地峽,認(rèn)為，如果這一目標(biāo)實(shí)現(xiàn)，西班牙的整個美洲運(yùn)輸線將被迫中斷。

但是，1595年7月，兩條情報傳到英國，其一是一支西班牙艦隊將在冬季前駛向愛爾蘭，其二是比1588年更強(qiáng)大的一支無敵艦隊將在1596年6月或7月進(jìn)攻英國。

因此,伊麗莎白下令改變德雷克的行動計劃，首先應(yīng)當(dāng)像1587年那樣盡最大努力在西班牙海岸摧毀無敵艦隊的船只,然后才能駛向西印度,并且，必須保證在1596年5月前回到英國。

這一計劃遭到德雷克等人的強(qiáng)烈反對，他們聲稱，如果計劃改變，伊麗莎白女王將負(fù)擔(dān)一切費(fèi)用，包括船只、供應(yīng)、步兵和水兵的薪餉。

女王不得已于8月批準(zhǔn)德雷克的計劃，船隊由6艘王家船只和13艘商船組成，女王負(fù)責(zé)2/3費(fèi)用，其它由總指揮德雷克和霍金斯及支持者承擔(dān)。由于德雷克與霍金斯間的爭吵以及德雷克指揮上的失誤，遠(yuǎn)航?jīng)]取得任何收獲。