阿克巴18歲時，他奪回大權(quán)，命令他的舅父到圣地麥加退隱。阿克巴終于自己獨(dú)力執(zhí)政了。 阿克巴擺脫左右羈絆后，便開始擴(kuò)張領(lǐng)土的征討，他對不同的地區(qū)采用不同的政策。對表示愿意歸順的地區(qū)，他仍讓原來的頭領(lǐng)管理土地，并對他的子孫委以重任。

1567年，阿克巴攻打梅瓦爾，用了4個月的時間攻下，屠殺了3萬人，并把作為王國象征的大銅鼓和母神座上的大燭臺拆下，當(dāng)做自己的戰(zhàn)利品。阿克巴用武力和懷柔的手段，15年的時間里統(tǒng)一了北印度。

他又用16年時間把版圖擴(kuò)大到遙遠(yuǎn)的西北地方。最后，他又用了3年的時間，平定了南方的幾個王國，從而建立了一個強(qiáng)大的莫臥兒帝國。

為了鞏固自己的政權(quán)，他對自己國家的內(nèi)務(wù)進(jìn)行改革整頓。他命令官員重新丈量土地，將帝國分為182個稅區(qū)，嚴(yán)格分別等級征稅；他還廢除將戰(zhàn)俘賣為奴隸的習(xí)俗；下令取消人頭稅、香客稅（對朝圣的印度教徒征服的稅）、田賦附加稅，遇到天災(zāi)人禍，則一律免交田賦；阿克巴統(tǒng)一了全國度量衡，有力地促進(jìn)了工商業(yè)的發(fā)展。

阿克巴信仰伊斯蘭教，而印度長期流行的是印度教，因此印度教和伊斯蘭教之間經(jīng)常發(fā)生矛盾沖突，這極大地影響了國家的安定團(tuán)結(jié)。

為了協(xié)調(diào)印度教和伊斯蘭教教徒們的關(guān)系，阿克巴采取了一系列的措施，他宣布各教派平等，他選用印度教人士做高級官員。

阿克巴自己還在宮庭中采納印度教慣例。阿克巴出于自己“寬容大度的個性”和自己“對宗教思想的追求”，他還創(chuàng)立了一個沒有上帝、沒有先知、沒有教務(wù)的“圣教”。