唐高宗、武則天時(shí)期，摩尼教逐漸在安西都護(hù)府傳播。武后延載元年（694年），波斯人拂多誕(Mihr-Ohrmazd)將摩尼教傳入中國(guó)；唐朝大歷三年(768年)于長(zhǎng)安建有大云光明寺。

摩尼教在中國(guó)又稱作明教，是因?yàn)樾磐椒Q呼他們的神為“明尊”。但摩尼教在初入華時(shí)其實(shí)并不順利，他們?cè)O(shè)法假托佛教之名傳道。在唐玄宗開(kāi)元期間，吐火羅國(guó)王曾獻(xiàn)一慕阇于中國(guó)，獲唐室接待。不過(guò)，在安史之亂前，該教并未在中華設(shè)寺院，史書(shū)反而載有對(duì)該教之禁令。據(jù)《通史》所載，玄宗不久以摩尼教“本是邪見(jiàn)，妄稱佛教誑惑黎元”為由，下令中國(guó)人嚴(yán)禁參與。

摩尼教傳入唐朝的同時(shí)，亦于之后不久地傳入回紇，更被后者定為國(guó)教。安史之亂后，因回紇自恃助唐平亂有功，摩尼教徒藉回紇的支持，得以在唐國(guó)傳教。據(jù)《佛祖統(tǒng)記》載，唐代宗大歷三年，敕準(zhǔn)回紇摩尼教徒在長(zhǎng)安建摩尼寺──大云光明寺。其后，又應(yīng)回紇之請(qǐng)，于荊州、洪州、越州等州建寺。唐憲宗元和二年（807年），再于河南、太原建摩尼寺二所，并派專員保護(hù)。自此以后，摩尼教寺滿布中國(guó)境內(nèi)。摩尼教教士隨伊斯蘭教使者來(lái)華，他們得到唐帝禮遇，在中國(guó)迅速傳播。

后來(lái)，摩尼教先于祆教、景教被禁，摩尼教再不能在社會(huì)公開(kāi)傳教，轉(zhuǎn)而在民間秘密流傳，并漸與其他宗教結(jié)合，歷五代兩宋仍不衰。自此與下層的斗爭(zhēng)結(jié)合起來(lái)，成為農(nóng)民起義的號(hào)召旗幟之一。

五代后梁貞明六年（920年），毋乙、董乙以“末尼”為旗幟，在陳州（今河南淮陽(yáng)）造反。

后來(lái)，北宋徽宗宣和元年（1119年）的方臘之亂和建炎四年（1130年）鐘相起義，元惠宗至正十年（1351年）“明王出世”的韓山童、劉福通起義，都受摩尼教的影響。