劉伯溫害怕會帶來更大麻煩，便前往南京當(dāng)面向皇帝請罪，但朱元璋對此事全然不過問，劉伯溫申訴無門，憂郁成疾，很快就病倒了。此時，胡惟庸攜帶補藥前來探望病情，劉伯溫吃了胡惟庸送來的藥后，頓時感到有如拳頭大小的石頭般的硬物堵塞在胸口。劉伯溫又上奏朱元璋，但朱元璋依舊不管不問。這樣，又過了三個月，病情更加惡化。直到這時，朱元璋派人前去問候劉基，得知他已不能起床了，便下令讓他返回青田老家。返回家鄉(xiāng)不久，劉伯溫就離開了人世。隨著劉伯溫死去，他的死因也變成了一個懸案。

關(guān)于劉伯溫的死因，胡惟庸案發(fā)后有人告發(fā)說，劉伯溫是胡惟庸毒死的。朱元璋后來曾與劉伯溫的兒子談及此事，把責(zé)任一股腦兒推到“胡黨”身上。他說：“劉伯溫在這里時，滿朝都是胡黨，只是他一個不從，吃他們蠱了?！币馑际钦f劉基是被“胡黨”毒死的。

他還說：“劉伯溫在這里時，胡家結(jié)黨，只是老子說不倒?！敝煸肮_對外也是這樣說：“后來胡家結(jié)黨，（劉基）吃他下了蠱。只見一日（劉基）來（對）我說：‘上位，臣如今肚內(nèi)一塊硬結(jié)，諒看不好?！页怂退厝?，到家后不久就死了。后來宣得他兒子來問，說道漲起來緊緊的，后來瀉得癟癟的，卻死了，這正是著了蠱了。”

然而，胡惟庸真的是毒死劉伯溫的元兇嗎？有的學(xué)者提出不同的看法，他們認為，盡管朱元璋將劉伯溫之死全部推到“胡黨”身上，但事實上真正的幕后黑手可能正是朱元璋本人，胡惟庸毒殺劉伯溫，很可能是受了朱元璋的授意。之所以說朱元璋才是真正的兇手，理由如下：