劉伯溫害怕會(huì)帶來(lái)更大麻煩，便前往南京當(dāng)面向皇帝請(qǐng)罪，但朱元璋對(duì)此事全然不過(guò)問(wèn)，劉伯溫申訴無(wú)門(mén)，憂郁成疾，很快就病倒了。此時(shí)，胡惟庸攜帶補(bǔ)藥前來(lái)探望病情，劉伯溫吃了胡惟庸送來(lái)的藥后，頓時(shí)感到有如拳頭大小的石頭般的硬物堵塞在胸口。劉伯溫又上奏朱元璋，但朱元璋依舊不管不問(wèn)。這樣，又過(guò)了三個(gè)月，病情更加惡化。直到這時(shí)，朱元璋派人前去問(wèn)候劉基，得知他已不能起床了，便下令讓他返回青田老家。返回家鄉(xiāng)不久，劉伯溫就離開(kāi)了人世。隨著劉伯溫死去，他的死因也變成了一個(gè)懸案。

關(guān)于劉伯溫的死因，胡惟庸案發(fā)后有人告發(fā)說(shuō)，劉伯溫是胡惟庸毒死的。朱元璋后來(lái)曾與劉伯溫的兒子談及此事，把責(zé)任一股腦兒推到“胡黨”身上。他說(shuō)：“劉伯溫在這里時(shí)，滿朝都是胡黨，只是他一個(gè)不從，吃他們蠱了?！币馑际钦f(shuō)劉基是被“胡黨”毒死的。

他還說(shuō)：“劉伯溫在這里時(shí)，胡家結(jié)黨，只是老子說(shuō)不倒?！敝煸肮_(kāi)對(duì)外也是這樣說(shuō)：“后來(lái)胡家結(jié)黨，（劉基）吃他下了蠱。只見(jiàn)一日（劉基）來(lái)（對(duì)）我說(shuō)：‘上位，臣如今肚內(nèi)一塊硬結(jié)，諒看不好?！页怂退厝?，到家后不久就死了。后來(lái)宣得他兒子來(lái)問(wèn)，說(shuō)道漲起來(lái)緊緊的，后來(lái)瀉得癟癟的，卻死了，這正是著了蠱了?！?/p>

然而，胡惟庸真的是毒死劉伯溫的元兇嗎？有的學(xué)者提出不同的看法，他們認(rèn)為，盡管朱元璋將劉伯溫之死全部推到“胡黨”身上，但事實(shí)上真正的幕后黑手可能正是朱元璋本人，胡惟庸毒殺劉伯溫，很可能是受了朱元璋的授意。之所以說(shuō)朱元璋才是真正的兇手，理由如下：