那么，智后來又是如何與國清寺扯上關系的呢？這便與智二入天臺山是密不可分的。隋朝建立后，智與隋文帝以及當時尚在晉王府邸的楊廣關系不錯，他們對智的尊崇一如陳宣帝和陳后主，然而頻頻出入于權門豪宅并非智的初衷。他在回故鄉(xiāng)玉泉山隱居一段時期后，再次上了天臺山。這次上天臺山后他營建了許多殿宇，不過其中并沒有國清寺。可為什么說智沒有營建國清寺，國清寺卻與他密不可分呢？傳說智入天臺不久，即遇一老僧對他說：“山下有皇太子基，可造寺院?！敝钦f：“現在草舍尚且困難，何論此事？”老僧回答說：“禪師想要建造一座寺廟，山下有皇太子寺基。等到三國統(tǒng)一后，自然會有大貴人來建造的?！彼€預言說：“寺若成，國必清。

”這片“皇太子基”在天臺山南麓，五座明秀的山峰回環(huán)而立，從碧靄重重的峰巒上，東西兩方各有一道溪水跳蕩奔瀉而下，穿過疏林密石，在此匯成了一道較為開闊的澗流?！盎侍踊苯o智留下了深刻的印象，但是智生前未能了卻在此新辟寺院的夙愿。直到597年他臨終時，才在給楊廣的信中提出了這一請求：“山下一處，非常之好。又更仰為立一伽藍……不見寺成，瞑目為恨?！睏顝V接受了智的請求，601年，由楊廣資助、智繼承者灌頂主持修建，于是一座美輪美奐的佛宇在五峰雙澗之間出現了。

可是新寺院起初并不叫“國清寺”，而是叫天臺寺，此名一直沿用到607年隋煬帝（楊廣）繼位，此時他才想到智對自己提出的建議非常合理，加之煬帝也認為原寺名天臺寺太俗氣了，便下詔改天臺寺為國清寺，此后一千余年都用了這個名字。