戰(zhàn)爭(zhēng)打到1905年的5月間，局勢(shì)已經(jīng)明朗，俄國(guó)人敗局已定，同時(shí)也已經(jīng)把中國(guó)的東三省打得遍地彈痕，滿目狼煙；人民流離失所，國(guó)土黯然無(wú)色。日俄雙方這時(shí)再也無(wú)力繼續(xù)打下去了，其他列強(qiáng)也希望早日恢復(fù)遠(yuǎn)東地區(qū)的和平。于是6月，由美國(guó)總統(tǒng)羅斯福出面，進(jìn)行調(diào)停，為兩國(guó)所接受。8月9日，議和談判在美國(guó)的樸茨茅斯開(kāi)始。

清政府得知日俄兩國(guó)媾和的消息后，深恐他們?cè)谡勁袝r(shí)對(duì)中國(guó)東三省地區(qū)進(jìn)行瓜分，于是在談判開(kāi)始前分別向兩國(guó)政府照會(huì)，聲稱“此次日俄戰(zhàn)爭(zhēng)曾在中國(guó)疆土用武，現(xiàn)在議和條款內(nèi)，倘有牽涉中國(guó)事件，凡此次未經(jīng)與中國(guó)商定者，一概不能承認(rèn)”。

但是，日俄議和實(shí)際上就是雙方要根據(jù)各自在戰(zhàn)爭(zhēng)中的勝與敗，重新確立自己在中國(guó)東三省地區(qū)的地位和利益，對(duì)于中國(guó)政府的合理要求，日俄兩國(guó)都沒(méi)有予以理睬。在談判期間，同樣沒(méi)有與清政府進(jìn)行商議，即擅自在關(guān)于中國(guó)東三省地區(qū)的問(wèn)題上達(dá)成了妥協(xié)。

1905年9月5日，日俄兩國(guó)簽訂《樸茨茅斯條約》，計(jì)正約十五款，附約兩款。其中涉及到中國(guó)主權(quán)的內(nèi)容主要有：

一、俄國(guó)將包括旅順口、大連灣在內(nèi)的遼東半島租借地，及附屬的一切公共財(cái)物，讓與日本；

二、俄國(guó)將從長(zhǎng)春到旅順口的鐵路及其一切支線，鐵路區(qū)域內(nèi)所附屬的一切權(quán)益、財(cái)產(chǎn)讓與日本；

三、兩國(guó)在東三省各自經(jīng)營(yíng)的鐵路，只限于工商業(yè)用，不得用于軍事目的，但遼東半島租借地內(nèi)的鐵路不在此限；