出于對(duì)湯若望和南懷仁的信任以及清朝官員沒(méi)有國(guó)際法的概念，康熙對(duì)同為傳教士的徐日升和張誠(chéng)賦予重任，派遣派遣徐日升和張誠(chéng)作為中國(guó)使團(tuán)的成員，還將自己的袍褂賜予徐日升，又為張誠(chéng)特制了一件，并授予他們?nèi)讽敶??；实蹏诟浪黝~圖和佟國(guó)綱說(shuō)：“朕鑒于所用西人，皆忠貞可靠，足資信賴(lài)，特令徐日升隨爾前往俄國(guó)?！币麄兣c二教士同桌就餐，重要的事情要與之商量。

此行極為不順甚至不得不折返京，后來(lái)中俄雙方經(jīng)過(guò)磋商，同意在尼布楚重開(kāi)談判。中方再次組團(tuán)于1689年6月離京。鑒于形勢(shì)有所逆轉(zhuǎn)，康熙授意索額圖在劃定邊界上可以稍稍作些讓步，即如果俄方堅(jiān)持，可以讓出尼布楚，而以額爾古納河為界。與上次相同，徐日升和張誠(chéng)隨團(tuán)前往。

7月13日，中國(guó)使團(tuán)抵達(dá)亞布楚，俄國(guó)使團(tuán)已在此等候。費(fèi)耀多羅·亞歷克塞耶維奇·戈洛文為俄國(guó)全權(quán)使臣。經(jīng)過(guò)2個(gè)月的談判，在徐日升和張誠(chéng)的協(xié)助下，中方放棄了貝加爾湖以東的一些領(lǐng)土，但換取俄方撤離雅克薩的讓步，最終于9月7日正式簽訂了《尼布楚條約》。

然而這些傳教士并沒(méi)有康熙認(rèn)為的那樣忠誠(chéng)。

來(lái)自比利時(shí)的南懷仁有開(kāi)辟一條歐亞陸地交通線(xiàn)的打算。這一方面是因?yàn)楹Ｉ辖煌ň€(xiàn)極不安全。1680年的統(tǒng)計(jì)數(shù)字表明，在那之前被派往中國(guó)的600名傳教士中，只有大約100人安全到達(dá)。而另一方面則是為了減少對(duì)葡萄牙人的過(guò)分依賴(lài)。因?yàn)閺臍W洲到遠(yuǎn)東的航線(xiàn)是控制在葡萄牙人手里的。所以南懷仁希望耶穌會(huì)士在中俄談判中發(fā)揮作用，達(dá)成一項(xiàng)“雙贏(yíng)”的和平協(xié)議。雙方都將感謝耶穌會(huì)士的功勞，而俄國(guó)最后會(huì)開(kāi)放西伯利亞這條通道。

因此，南懷仁在中國(guó)準(zhǔn)備對(duì)侵略黑龍江流域的沙俄軍隊(duì)進(jìn)行反擊前，向俄國(guó)來(lái)華使臣提供偷竊的機(jī)密地圖和情報(bào)，鼓動(dòng)俄國(guó)擴(kuò)大對(duì)華戰(zhàn)爭(zhēng)，并表示，“為了基督教，將盡力為沙皇效力”。1686年，他致信俄國(guó)使臣“我認(rèn)為如果俄國(guó)大使先生們來(lái)時(shí)，那怕只帶一名懂拉丁語(yǔ)的人，這對(duì)大會(huì)也是有利的。在談判過(guò)程中，耶穌會(huì)士力爭(zhēng)使用拉丁語(yǔ)?！?