后來(lái)，法院決定公審川島芳子，《民國(guó)日?qǐng)?bào)》等報(bào)刊也分別刊登了公審川島芳子的消息，出于好奇心人們?nèi)绯彼愕赜肯蚍ㄔ?，熱鬧的人群把法院擠得水泄不通，憲兵苦苦在門口阻攔騷動(dòng)的人群。1947年2月8日上午9時(shí)，法官宣布開庭，法警撥開人群，將穿著白絨運(yùn)動(dòng)衣的川島芳子帶入法庭，法庭里人聲鼎沸、影機(jī)轉(zhuǎn)動(dòng)。

皮膚細(xì)白、身體矮胖的川島看了一下旁聽(tīng)席后，坐在被告席面對(duì)法官。接著法官起訴，大意是：金碧輝，中國(guó)人，同日本勾結(jié)指揮滿洲國(guó)軍，日華事變中為在中國(guó)建偽政權(quán)，拉攏汪精衛(wèi)并為日本當(dāng)間諜，要求判死刑并出示3件證物。法官讀訴后，川島芳子進(jìn)行了駁訴，并申述了己見(jiàn)，但最終仍被判處死刑。

1948年3月26日，各報(bào)都突出報(bào)道了大名鼎鼎的日本密探金碧輝被處死刑的消息。聞?dòng)嵹s到的記者們?yōu)榱伺牡叫行态F(xiàn)場(chǎng)，半夜就到第一監(jiān)獄等待。到了凌晨4點(diǎn)，監(jiān)獄門才打開，但是，只允許3個(gè)外國(guó)記者入內(nèi)采訪拍照。中午時(shí)分，川島芳子的遺體從獄里抬出，人們揭開席看時(shí)，只見(jiàn)她蓬頭散發(fā)，臉、脖子全涂有污泥，不像是川島芳子。

尸體很快就交日本和尚大川長(zhǎng)老火化了。于是，群眾紛紛向法院、報(bào)社質(zhì)問(wèn)：為何審問(wèn)時(shí)拍紀(jì)錄片，行刑神秘？為何只許外國(guó)記者入內(nèi)，而中國(guó)記者被趕出現(xiàn)場(chǎng)？為何將面部搞成血泥難辨？為何行刑后封閉現(xiàn)場(chǎng)？在人們的責(zé)問(wèn)聲中，監(jiān)獄一位女看守向人們展示了川島行刑后的照片，算作了交代，但這些做法，并沒(méi)有消除人們對(duì)川島芳子神秘之死的疑問(wèn)。