施今墨又是進行中醫(yī)革新和中西醫(yī)結合的先驅(qū)。早在20年代，就開始應用西醫(yī)病名。曾提出“中醫(yī)現(xiàn)代化，中藥工藥化”的口號。他認為，醫(yī)學是和死亡作斗爭的科學，應該與時俱進，精益求精。

他主張中醫(yī)與西醫(yī)并存，最早提倡互相結合，取長補短。提出“學術無國界而各有增長?！薄霸\斷以西法為精密，處方以中藥為完善。”“無論中醫(yī)西醫(yī)，其理論正確，治療有效者，皆信任之；反之，摒棄不可用也?！?/p>

施今墨還十分重視和關心中醫(yī)人才的培養(yǎng)和中醫(yī)學術思想的傳播，為我國中醫(yī)事業(yè)的長足發(fā)展做出了重要貢獻。1932年他在北京創(chuàng)辦了華北國醫(yī)學院，講授中西醫(yī)課程，是中國近代史上第一所新型醫(yī)學院。還創(chuàng)辦過中醫(yī)學校、中醫(yī)講習所和中醫(yī)研究所等。

1954年，施今墨在受到周恩來總理的接見時，還提出建議，成立中醫(yī)科學研究院、中醫(yī)醫(yī)院、中醫(yī)醫(yī)學院。

在一次中醫(yī)中藥展覽會上，施今墨曾就出了治療胃潰瘍、十二指腸潰瘍、高血壓、神經(jīng)衰弱、肝硬化、肝脾腫大、氣管炎等病的十大驗方。據(jù)此制成的“高血壓速降丸”、“神經(jīng)衰弱丸”、“感冒丸”、“氣管炎丸”等曾暢銷海內(nèi)外。

新中國成立后，施今墨曾任北京醫(yī)院中醫(yī)顧問、中醫(yī)研究院顧問、中華醫(yī)學會副會長等，被邀請擔任第二、三、四屆全國政協(xié)委員。十年“文革”動亂中，施今墨也遭到了迫害。