此時(shí)晉陽城守將叛燕，逼使慕容農(nóng)率眾東走。長(zhǎng)孫肥率眾追擊，在潞川追上，慕容農(nóng)妻兒被擄，只率三騎逃回中山。拓跋珪于是攻取并州之地，并置官員治理當(dāng)?shù)亍?/p>

隨后，拓跋珪命于栗磾及公孫蘭等暗中開通昔日韓信在井陘用過的路，并在十月率軍取道該路進(jìn)攻中山城。其時(shí)燕軍決意嬰城自守，打持久戰(zhàn)，于是拓跋珪在攻下常山后，其東各郡縣的官員不是棄城就是投降，北魏于是輕易地得到中原大部分郡縣歸附，僅余中山、鄴及信都三城仍然拒守。

拓跋珪于是兵分三路分攻三城：自攻中山，拓跋儀攻鄴及王建、李栗攻信都。然而，拓跋珪在攻中山城時(shí)遭燕軍力拒，于是暫時(shí)放棄進(jìn)攻中山，改南取其余二城。

皇始二年（397年）正月，拓跋珪加入進(jìn)攻信都，終于逼得后燕守將宜都王慕容鳳棄城出走，但其時(shí)后燕重臣范陽王慕容德卻成功離間進(jìn)攻鄴城的拓跋儀及賀賴盧，令他們退兵，并乘機(jī)從后追擊，大破魏軍。

三月，燕帝慕容寶向拓跋珪求和，并說要送還拓跋觚，并割讓常山以西土地。拓跋珪已答允，但慕容寶卻反悔，拓跋珪于是進(jìn)圍中山。

最終慕容寶等人棄中山城出走，拓跋珪原本打算在該晚入城，王建則以士兵會(huì)乘夜盜取城中財(cái)寶為由勸阻，拓跋珪于是等到日出才入城。可是慕容詳卻趁機(jī)自立為主，閉門拒守，拓跋珪試圖強(qiáng)攻但攻了幾日都不果，于是試圖勸降，可是城中軍民卻表示擔(dān)心會(huì)有昔日在參合陂被殺的燕降卒一樣的下場(chǎng)，所以堅(jiān)守到最后。

拓跋珪想起當(dāng)日勸他殺俘的正是王建，導(dǎo)致難取中山，于是向其吐口水。至五月，拓跋珪撤圍，到河間補(bǔ)充軍糧。在圍攻中山的同時(shí)，拓跋珪派庾岳率兵討平國(guó)內(nèi)反叛的賀蘭部、紇鄰部及紇奚部，成功解決內(nèi)亂。