在沿東非大裂谷形成的湖泊中，坦噶尼喀湖、馬拉維湖和維多利亞等淡水湖泊由于四周有干旱荒漠阻隔，湖水里生活著數(shù)百種其他地方?jīng)]有的魚。

三個湖中最淺的維多利亞深100米，這個湖也是形成最晚的，只有近75萬年的歷史。此湖形成時，西面的土地隆起，把數(shù)條河流的河道截斷，結(jié)果河道加深加寬，成為小湖。維多利亞湖本身也經(jīng)歷變遷，在泛濫時會把原來與外界隔絕水體中的生物接收過來，在干旱期，湖中生物又會回到與世隔絕的生活。

形成裂谷的地方都位于地殼的“熱點”上，溫差與密度的差別令熔巖升向地殼表面，沿著裂谷的軸線火山活動頻繁。非洲大陸上的最高峰——乞力馬扎羅山與肯亞山就在裂谷的軸線上，第三大火山坦桑尼亞北部的恩戈羅山已坍塌的火山口成為非洲最佳野生動物保護區(qū)，火山口內(nèi)有一個天然灌溉系統(tǒng)，全年水分充足。西面的塞倫蓋蒂平原可容下比恩戈羅多100倍的動物。

古往今來，東非大裂谷一直引人注目；當今世界，東非大裂谷的未來命運，更是舉世關(guān)注。美國地理學(xué)家約翰·喬治，曾在1893年對裂谷進行了5個星期的實地調(diào)查。他推測：東非裂谷不是由河流沖刷而成，而是因為地殼下沉，形成了一個兩邊峭壁相夾的溝谷凹地。