在沿東非大裂谷形成的湖泊中，坦噶尼喀湖、馬拉維湖和維多利亞等淡水湖泊由于四周有干旱荒漠阻隔，湖水里生活著數(shù)百種其他地方?jīng)]有的魚(yú)。

三個(gè)湖中最淺的維多利亞深100米，這個(gè)湖也是形成最晚的，只有近75萬(wàn)年的歷史。此湖形成時(shí)，西面的土地隆起，把數(shù)條河流的河道截?cái)?，結(jié)果河道加深加寬，成為小湖。維多利亞湖本身也經(jīng)歷變遷，在泛濫時(shí)會(huì)把原來(lái)與外界隔絕水體中的生物接收過(guò)來(lái)，在干旱期，湖中生物又會(huì)回到與世隔絕的生活。

形成裂谷的地方都位于地殼的“熱點(diǎn)”上，溫差與密度的差別令熔巖升向地殼表面，沿著裂谷的軸線火山活動(dòng)頻繁。非洲大陸上的最高峰——乞力馬扎羅山與肯亞山就在裂谷的軸線上，第三大火山坦桑尼亞北部的恩戈羅山已坍塌的火山口成為非洲最佳野生動(dòng)物保護(hù)區(qū)，火山口內(nèi)有一個(gè)天然灌溉系統(tǒng)，全年水分充足。西面的塞倫蓋蒂平原可容下比恩戈羅多100倍的動(dòng)物。

古往今來(lái)，東非大裂谷一直引人注目；當(dāng)今世界，東非大裂谷的未來(lái)命運(yùn)，更是舉世關(guān)注。美國(guó)地理學(xué)家約翰·喬治，曾在1893年對(duì)裂谷進(jìn)行了5個(gè)星期的實(shí)地調(diào)查。他推測(cè)：東非裂谷不是由河流沖刷而成，而是因?yàn)榈貧は鲁?，形成了一個(gè)兩邊峭壁相夾的溝谷凹地。