路德教諸侯不顧“宗教權(quán)益保留”繼續(xù)掠奪教產(chǎn)，天主教諸侯利用教隨國(guó)定原則繼續(xù)反對(duì)宗教改革。奧格斯堡宗教和約使諸侯在已有的大權(quán)外又獲得決定臣民宗教信仰的權(quán)力，勢(shì)力大大加強(qiáng)。和約簽訂不久，查理五世宣布退位，帝國(guó)瓦解，腓迪南統(tǒng)治奧地利、捷克和部分匈牙利，襲帝位；其子統(tǒng)治西班牙、尼德蘭和海外領(lǐng)地。從此出現(xiàn)兩支哈布斯堡王室。

《奧格斯堡宗教和約》的基本原則，其實(shí)早在1526年的施佩耶爾帝國(guó)議會(huì)和1532年的紐倫堡帝國(guó)議會(huì)上多少已有，但天主教方面總是不愿遵守。經(jīng)過幾十年的較量，天主教諸侯終于懂得不承認(rèn)路德派終究不是解決問題的辦法，只好回到原來的起點(diǎn)上。有人說和約確定了信仰自由?？墒?，信仰自由是屬于諸侯的，與一般群眾無緣，他們只能根據(jù)諸侯的信仰來確定自己的信仰。

《奧格斯堡宗教和約》在西歐也有一定影響。根據(jù)當(dāng)時(shí)的概念，所謂神圣羅馬帝國(guó)泛指整個(gè)西歐。此后，教皇不能僅僅因?yàn)槟橙诵欧盥返陆叹陀枰则?qū)逐出教。英國(guó)女王伊麗莎白一世深深懂得這一點(diǎn)，刪去她的信條中可能與路德派矛盾的地方，對(duì)付羅馬的刁難。1570年，教皇把女王驅(qū)逐出教，理由僅僅是她采用了卡爾文教邪惡的圣餐禮，沒有提到其他。