有了共同話題還不足以跟皇上搞好關系，畢竟皇上身邊的能臣一抓一大把。

那就必須得下點功夫了，高士奇數(shù)十年如一日，堅持讀書，學習經學、詩文、前史、數(shù)學以及西方近代天然科學知識，投其所好，康熙想聽什么高士奇就講什么，問他什么也能回答個八九不離十。

高士奇不僅文化素質高，而且精通于揣摩圣意，就像康熙肚子里的蛔蟲，做的每件事，說的每句話都討皇帝歡心，這樣的人才誰不愛呢。所以高士奇在南書房成為了康熙片刻不能脫離的人。只要康熙有事叫他，他一定在。

據(jù)說高士奇在南書房當值期間連廁所都不去，就好像是一個機器人，不吃不喝，24小時為皇上服務。

如此這般，也不是普通的人能做到的。高士奇終于與康熙無話不談，形影不離，兩人的關系算是亦師亦友，因此康熙根本離不開高士奇。

康熙對高士奇器重，高士奇卻日漸自大，背公行私，招搖撞騙，諂附大臣，結黨營私，收受賄賂，已然構成欺君之罪。若是放在其他帝王身上，高士奇早就被斬首示眾了，可康熙僅僅判了他休致回籍，足見對高士奇的情深義重了。

離開京城時，康熙讓高士奇從翰林院帶些書籍回鄉(xiāng)編纂，以示還有復官的機會。后來康熙幾次南巡，高士奇都奉命前來迎駕，不過此時高士奇已厭倦官場生涯，不愿復出做官。高士奇于康熙四十二年（1703年）在老家浙江余姚病故，享年六十歲。