后趙政權(quán)滅亡后，北方地區(qū)被前秦所統(tǒng)一，其后有兩個(gè)割據(jù)政權(quán)設(shè)置了“南京”（南都），分別是盤踞河套平原與鄂爾多斯高原的胡夏政權(quán)與盤踞雁北地區(qū)的代政權(quán)。

胡夏是赫連勃勃建立的政權(quán)，起初以統(tǒng)萬城（陜西省橫山縣白城子村）為都，后來赫連勃勃趁著劉裕北伐軍主力回撤南方及留守部隊(duì)內(nèi)訌的機(jī)會(huì)，奪取了關(guān)中地區(qū)（公元418年），而后赫連勃勃為了保持對(duì)關(guān)中地區(qū)的統(tǒng)治，便以長(zhǎng)安為“南京”（“南臺(tái)”），以統(tǒng)萬城為“北京”。

代國(guó)是拓跋猗盧在桑干河平原與敕勒川建立的政權(quán)，代國(guó)政權(quán)從公元313年開始，以盛樂城（內(nèi)蒙古和林格爾縣）為北都，以平城（山西省大同市）為南都，實(shí)行了小半個(gè)世紀(jì)的“兩都制”。

此后的數(shù)個(gè)政權(quán)均偏安一隅，沒有條件實(shí)行“多都制”，“南京”之名也就消失了很長(zhǎng)一段時(shí)間。