在埃及的三年期間，岡比西斯的癲癇病越來越厲害，發(fā)狂的時候也越來越多。許多大臣每天都是如履薄冰，小心翼翼的行事，生怕一不留神惹怒岡比西斯，將他們其中的哪一個殺掉。

就在岡比西斯在埃及胡作非為的時候，波斯國內出現了大亂。在岡比西斯皇宮里，有一個叫高墨達的拜火教僧侶，利用波斯人對岡比西斯暴虐無道的不滿情緒，假冒被岡比西斯殺死的王子巴爾迪亞的名義，于公元前522年3月，在首都愛克巴坦那發(fā)動了政變，宣布廢黜岡比西斯，自立為波斯皇帝。

政變之后，高墨達又宣布，免去帝國境內所有人民三年捐稅和兵役。高墨達的這項措施大得民心。大多數波斯人、米底人、巴比倫人、亞述人早就痛恨岡比西斯的暴政，因此高墨達的免征賦稅和兵役的措施一頒布，人人都說新皇帝好，紛紛起來擁戴冒名巴爾迪亞的高墨達。一些不滿當地豪門貴族的百姓，也趁機揭竿而起，將那些經常作惡多端的富豪，殺死或趕走，把他們的家財分光。

岡比西斯得到國內大亂的消息后，急忙率領部隊回國，準備奪回王位。就在他上馬準備啟程時，他的佩刀刀鞘的扣子，突然彈開，刀從鞘中滑了出來，鋒利的刀刃把岡比西斯的大腿割了一道血口，岡比西斯痛得從馬上跌了下來。

這樣，岡比西斯只好暫時放棄了親自殺回波斯的計劃，派了一員親信大將，帶著一支部隊先行趕回波斯。但是這支部隊在埃及的大沙漠中遇到了沙暴，全軍覆沒，長眠在沙漠之中。后來，他們的木乃伊被現代考古學家們發(fā)現。