不久以后，瑪麗就懷孕了。但達恩利很快就變得傲慢自大，桀驁不遜，貪求權(quán)力，要求在他的頭銜上贈以“國王”的名號。但在某一場合，他襲擊了瑪麗，試圖想讓瑪麗因此流產(chǎn)，卻失敗了。

他嫉妒瑪麗與她私人秘書，大衛(wèi)·里齊奧之間的情誼，在1566年3月，達恩利進入?yún)⑴c了一個在蔡斯襲擊中反叛瑪麗的貴族組成的秘謀組織。

3月9日，一個貴族團體，伙同達恩利，在斯特林宮刺殺了里齊奧，當(dāng)時他和瑪麗、阿艾爾夫人等正在玩紙牌。這次行動加速了瑪麗與達恩利婚姻的破裂。達恩利很快再次改變了立場與那些參與刺殺的貴族決裂。

隨著1566年7月，瑪麗的繼承人（即以后的英格蘭詹姆士一世、蘇格蘭詹姆士六世）出世，一個除掉達恩利的陰謀正逐漸形成，因為此時瑪麗無可救藥愛上了一個黑色大理石一樣的男人--博思韋爾伯爵，伯爵粗狂豪放的男性魅力瞬間將瑪麗從未失去的驕傲、自信及理性碾的粉碎。

和伯爵相比，弟弟一樣的弗朗索瓦二世和徒有外表的小白臉達恩利完全失去了色彩。她曾寫詩自供“為了他，從那天起，我放棄了名譽；為了他，我賭上了權(quán)勢和良心；為了他，我拋棄了親人和好友[10] ?！?/p>

此時的達恩利正重病纏身（有可能是梅毒），他被安排在愛丁堡的一幢別墅里康復(fù)。1567年2月，別墅里發(fā)生了一次爆炸，爆炸發(fā)生后，在花園里發(fā)現(xiàn)了已經(jīng)咽氣的達恩利。他看起來是被掐死的。

這一事件原本是對瑪麗的一種解脫，卻不想敗壞了她的名譽。大家都把注意力放到了博思韋爾伯爵身上，認為他刺殺了達恩利，由此招致了一場對博斯維爾的審判，但最后法庭宣判他無罪。