但是當(dāng)時(shí)倒幕的勢(shì)力，如護(hù)良親王、河內(nèi)國(guó)的楠木正成、播磨國(guó)的赤松則村（圓心）等人，活躍于日本各地，紛紛表示效忠于后醍醐。

元弘三年/正慶二年（1333年）后醍醐天皇在名和長(zhǎng)年等人的幫助下逃離隱岐島，逃至伯耆國(guó)船上山（今鳥(niǎo)取縣東伯郡琴浦町內(nèi)）舉兵討幕。

鐮倉(cāng)幕府的執(zhí)權(quán)北條守時(shí)派遣足利高氏（即后來(lái)的足利尊氏）前往征討，但足利高氏卻倒向了后醍醐一方，攻陷了幕府的六波羅探題。此后新田義貞在東國(guó)舉兵，攻陷鐮倉(cāng)，北條氏和鐮倉(cāng)幕府一起滅亡了。

四、建武新政

回到京都的后醍醐天皇不承認(rèn)光嚴(yán)天皇皇位的合法性，尊之為上皇，剝奪了他所有權(quán)力。同時(shí)廢除了幕府和攝關(guān)制度，建立了天皇獨(dú)裁政權(quán)，由天皇自行任免官職。

這就是歷史上的建武新政。同時(shí)廢去了邦良親王遺孤康仁親王的皇位繼承權(quán)，將自己的兒子恒良親王立為皇太子。

建武新政表面上是復(fù)古，事實(shí)上建立了天皇專(zhuān)制政權(quán)。而且其激進(jìn)的改革、恩賞的不公平、朝令夕改的法令和政策以及對(duì)貴族、大寺社、武士等較大勢(shì)力集團(tuán)權(quán)利的侵害，最終導(dǎo)致了新政的失敗。

公卿們也對(duì)新政持冷漠態(tài)度，著名的二條河原落書(shū)就對(duì)新政的無(wú)能進(jìn)行了批判。同時(shí)，征夷大將軍護(hù)良親王在倒幕中功勛卓著，但在足利尊氏的讒言下，被天皇放逐到了鐮倉(cāng)。

五、足利尊氏的反叛

建武二年（1335年），足利尊氏借鎮(zhèn)壓中先代之亂的契機(jī)前往東國(guó)，鎮(zhèn)壓成功之后在鐮倉(cāng)自行封賞有功的將領(lǐng)，與新政對(duì)抗。