天圣五年（1027年），以刑部侍郎貶知宣州，后改知應天府。在此期間，他極重視書院的發(fā)展，大力扶持應天府書院，力邀范仲淹到書院講學，培養(yǎng)了大批人才。該書院（又稱“睢陽書院”）與白鹿洞、石鼓、岳麓合稱宋初四大書院。這是自五代以來，學校屢遭禁廢后，由晏殊開創(chuàng)大辦教育之先河。慶歷三年在宰相任上時，又與樞密副使范仲淹一起，倡導州、縣立學和改革教學內(nèi)容，官學設教授。自此，京師至郡縣，都設有官學。這就是有名的“慶歷興學”。

明道元年（1032年），晏殊升任參知政事（副宰相）加尚書左丞。第二年因諫阻太后“服袞冕以謁太廟”，貶知亳州、陳州。五年后召任刑部尚書兼御史中丞，復為三司使。時值李元昊稱帝，建立西夏國，并出兵陜西一帶，而宋將屢屢敗退。晏殊全面分析當時的軍事形勢，從失利中找原因，針對存在的問題，奏請仁宗后，辦了四件加強軍備的大事：撤消內(nèi)臣監(jiān)軍，使軍隊統(tǒng)帥有權(quán)決定軍中大事；召募、訓練弓箭手，以備作戰(zhàn)之用；清理宮中長期積壓的財物，資助邊關軍餉；追回被各司侵占的物資，充實國庫。由此，宋軍很快平定了西夏的進犯。

慶歷二年（1042年），晏殊官拜宰相，以樞密使加平章事。第二年，以檢校太尉刑部尚書同平章事，晉中書門下平章事，集賢殿學士，兼樞密使。慶歷四年（1044年），因撰修李宸妃墓志等事，遭孫甫、蔡襄彈劾，貶為工部尚書知穎州，后又以禮部、刑部尚書知陳州、許州。60歲時以戶部尚書、觀文殿大學士知永興軍節(jié)度使（今陜西西安）。后調(diào)到河南府，官銜被轉(zhuǎn)到兵部。