無專官，無衙署，就使軍機處成為一種特殊的機構(gòu)。召見時，雍正帝指示各項事件應(yīng)如何辦理，有時向軍機大臣詢問情況，聽取他們的意見，以作出裁決。軍機大臣根據(jù)旨意，草擬文書。上諭形成后，不經(jīng)過內(nèi)閣，由軍機處直接發(fā)給有關(guān)官員。

軍機處的發(fā)展歷史

軍機處唯一的一次尾大不掉，是在和珅擔(dān)任領(lǐng)班時期。和珅掌權(quán)后，身兼軍機大臣和御前大臣，打破了制衡的框架，要求“凡有奏折令具副本關(guān)會軍機處”。如此以來，在制度設(shè)計上，就令軍機處的地位大大提高，不僅參與決策，還實際掌控了信息渠道，皇帝被操縱的風(fēng)險大大增加。

嘉慶帝在翦除和珅后，立即廢除此條。此外，嘉慶帝還多次刻意地挫壓朝臣中尊崇軍機處的風(fēng)氣，并否決了一位官員提出的在奏折內(nèi)將軍機處抬寫以示尊重的建議。

嘉慶帝對于軍機處的一連串打壓，主要是基于對和珅專權(quán)的撥亂反正，他本人對于軍機處的作用并不否定。在嘉慶時期，軍機處被提高到了“平章軍國重事”的宰輔地位。并且在制度的多方約束下，軍機處的確在成為一只有力的臂膀的同時，并不傷及政權(quán)肌體。

道光帝時期，各處發(fā)往軍機處的奏折必須先經(jīng)皇帝之手之后，軍機大臣才能閱覽。道光三十年（1850年）咸豐帝繼承帝位后，奕訢被封為恭親王。不久他又進(jìn)入軍機處，咸豐帝又命他在內(nèi)廷行走。咸豐十一年（1861年）成立總理各國事務(wù)衙門后，軍機處之決策權(quán)漸移。