1967年，與陳堃銶結(jié)為夫妻，搬回北大。

1968年3月，再回上海養(yǎng)病。父親被打為“現(xiàn)行反革命”，成為“專政對象”，家中環(huán)境大變。同年12月被扣上“偷聽敵臺廣播”的帽子，召回北大，進學(xué)習(xí)班“交待問題”，只能周末回家。在陳堃銶的理解、鼓勵和照顧下，度過了艱難歲月。

1969年，因身體狀況不佳，被命從“學(xué)習(xí)班”回家“思過”，成為被打入“另冊”、只拿勞保工資、長期在家養(yǎng)病的老病號。

1972年，從同事處得知，北大參與研制的DJS150計算機遇到磁帶糾錯的難題。在家用手工對幾百種編碼方案進行篩選、計算，設(shè)計出磁帶2位糾錯方案。

1975年，王選投入到“748工程”，即漢字信息處理系統(tǒng)工程研制工作中。

1975年開始，王選作為技術(shù)總負責人，領(lǐng)導(dǎo)中國計算機漢字激光照排系統(tǒng)和后來的電子出版系統(tǒng)的研制工作，這一系統(tǒng)處于國內(nèi)外領(lǐng)先地位，使中國沿用了上百年的鉛字印刷得到了徹底改造。

1975年到1993年這18年中，幾乎放棄了所有節(jié)假日，每天上、下午和晚上三段工作，身心極為緊張勞累。

1976年9月，電子工業(yè)部在了解了王選的方案后給予大力支持，把“748工程”中漢字精密照排系統(tǒng)的研制任務(wù)正式下達給北京大學(xué)，并成立了北京大學(xué)漢字信息處理技術(shù)研究室，由王選負責整個系統(tǒng)的總體設(shè)計和研制工作。

1979年7月27日，經(jīng)與協(xié)作單位共同努力，王選主持研制成功漢字精密系統(tǒng)的主體工程，從激光照排機上輸出一張八開報紙底片。國務(wù)院副總理方毅來北大參觀后，給予很高評價。