在調(diào)查過程中，麥克法蘭曾透露秘密交易事先得到過里根總統(tǒng)的批準。白宮辦公廳主任里甘卻說，里根總統(tǒng)沒有同意向伊朗出售武器。司法部長米斯也說，里根總統(tǒng)只是在美伊交易成為事實盾才得知這一情況的。但是，麥克法蘭卻在聽證會上肯定地說，他通知以色列向伊朗運送武器時，確實得到過里根總統(tǒng)的批準，時間是1985年8月6日或7日。

調(diào)查還證實，秘密交易的部分款項確實援助給尼加拉瓜的反政府武裝。盡管美國國會早在1984年春季就通過法案，禁止兩年內(nèi)對尼加拉瓜提供軍事援助。但白宮卻交給國家安全委員會助理諾思上校一個任務(wù)，要讓尼加拉瓜反政府武裝同桑地諾政府軍的戰(zhàn)爭進行到底。

司法部長米斯透露，確有一部分美伊武器交易的款項到了尼加拉瓜反政府軍手中。國會特別調(diào)查委員會聲稱，他們已經(jīng)得到證實，在美國國會禁止向尼加拉瓜反政府武裝提供軍事援助期間，里根政府卻向它提供了100多萬美元的援助，這筆錢來自于美國向伊朗出售武器所得的利潤。然而，里根一再表示他事先并不知道此事。

1987年5月1日至8月3日，美國國會在參眾兩院美伊武器秘密交易事件特別調(diào)查委員會舉行了聯(lián)合聽證會。調(diào)查委員會為使事件中的核心人物開口，批準給予波因德克斯特和諾思等15名重要當(dāng)事人以有限豁免權(quán)，即他們的證詞不得在刑事調(diào)查和起訴中作反對他們的證據(jù)。

在聽證會期間，美國各大電視網(wǎng)都進行了實況轉(zhuǎn)播，吸引了5000萬以上的電視觀眾。

8月12日，里根向全國發(fā)表了電視講話，承認對伊朗門事件負有領(lǐng)導(dǎo)上的責(zé)任，并說政府已從中吸取了教訓(xùn)，但堅持說他對款項轉(zhuǎn)移一事并不知情。調(diào)查結(jié)果表明，里根總統(tǒng)曾同意使用“武器交換人質(zhì)”的方案。他曾于1985午12月5日簽署了一件以武器交換人質(zhì)的文件。但里根要求他的高級助手們對美國公眾隱瞞向伊朗出售武器的事實。