針對中國肝癌合并肝硬化多，術(shù)后極易導(dǎo)致肝功能衰竭的特點(diǎn)，提出肝癌的局部根治性治療策略，使肝癌外科的療效和安全性得到有機(jī)統(tǒng)一。

上述研究使肝癌術(shù)后5年生存率由60-70年代的16.0%，上升到80年代的30.6%和90年代以來的48.6%，不斷豐富和發(fā)展了中國的肝臟外科事業(yè)。

3、創(chuàng)建了世界上規(guī)模最大的肝臟疾病研究和診療中心，培養(yǎng)了大批高層次專業(yè)人才

他領(lǐng)導(dǎo)的學(xué)科規(guī)模從一個“三人研究小組”發(fā)展到目前的三級甲等專科醫(yī)院和肝膽外科研究所，成為國際上規(guī)模最大的肝膽疾病診療中心和科研基地；

設(shè)立吳孟超肝膽外科醫(yī)學(xué)基金，獎勵為中國肝膽外科事業(yè)作出卓著貢獻(xiàn)的杰出人才和創(chuàng)新性研究；培養(yǎng)了大批高層次專門人才。

通過他和同行們的共同努力，推動了國內(nèi)外肝臟外科的發(fā)展，多數(shù)肝癌外科治療的理論和技術(shù)原創(chuàng)于中國，使中國在該領(lǐng)域的研究和診治水平居國際領(lǐng)先地位。

二、科學(xué)研究

20世紀(jì)50年代最先提出中國人肝臟解剖五葉四段新見解；

60年代首創(chuàng)常溫下間歇肝門阻斷切肝法，并率先突破人體中肝葉手術(shù)禁區(qū)；

70年代建立起完整的肝臟海綿狀血管瘤和小肝癌的早期診治體系，較早應(yīng)用肝動脈結(jié)扎法和肝動脈栓塞法治療中、晚期肝癌；

80年代，建立了常溫下無血切肝術(shù)、肝癌復(fù)發(fā)再切除和肝癌二期手術(shù)技術(shù)；

90年代，在中、晚期肝癌的基因免疫治療、肝移植等方面取得了重大進(jìn)展，并首先開展腹腔鏡下肝切除和肝動脈結(jié)扎術(shù)。