到了唐宋，就有了太醫(yī)署和太醫(yī)局，太醫(yī)制度得到進一步完善，到了元代，太醫(yī)院已經(jīng)成為了單獨的獨立機構(gòu)，負責(zé)皇室成員的醫(yī)療，太醫(yī)也是一個官職，由太醫(yī)官僚系統(tǒng)的工作人員組成的群體，他們分工明確，有分管藥材的，有分管行政的，有分管外診的，這些醫(yī)師都被成為太醫(yī)。

不過，太醫(yī)雖醫(yī)術(shù)精湛，但如果皇室成員得的是疑難雜癥，太醫(yī)醫(yī)治無果的情況下，皇帝就會從民間尋找其他醫(yī)術(shù)高明的醫(yī)師進攻看病，能成為皇室太醫(yī)的醫(yī)生數(shù)量還是很少的，據(jù)《清史稿.職官志》中有關(guān)太醫(yī)院的記載，太醫(yī)院的醫(yī)生分為四個等級，第一等級叫“御醫(yī)”，只設(shè)十三人，在清代官階為七品，和縣令是一個級別，第二等級稱“史目”，設(shè)有二十六人，其中八品十三人，九品十三人，第三等級為“醫(yī)士”，設(shè)有三十人，這一等級沒有官階，類似現(xiàn)代醫(yī)師助理。

從而可以看出，清代太醫(yī)院的編制人員共設(shè)有九十二人，其中御醫(yī)、史目、醫(yī)士這三個等級的醫(yī)師是可以獨自外出看病的。

而御醫(yī)是指專為皇族診治病患的大夫，所以這一等級的醫(yī)師屬皇室私人醫(yī)師，一般不給其他人診治，也有一些例外，那些對國家有著巨大貢獻的人，皇帝有時會派遣御醫(yī)為其治病。

總的來說，御醫(yī)是專門負責(zé)皇室成員的健康，醫(yī)術(shù)最為精湛，是最高階醫(yī)師的稱謂。太醫(yī)，是對太醫(yī)院所有醫(yī)生的統(tǒng)稱，也稱民間醫(yī)術(shù)高超的醫(yī)生，所以，御醫(yī)和太醫(yī)并不是一回事。